E-fatura uygulamasında iptal seçeneği yer almamaktadır. İstenilen iptal için başarılı bir şekilde gönderilen ve belge ID alan faturalarda GTB tarafından yapılan bir durumdur. Bu şekilde gönderilen e-faturaya tescil aşamasına kadar faturayı gönderen kişi GTB portalına giriş yaparak red işlemini tetikleyerek faturayı iptal ettirebilir. Ya da tescil aşamasında GTB tarafından reddedilir. Bu işlemlerin ardından istenilen fatura iptal edilmiş olur. Bu iptalin ardından yeni fatura düzenlenip gönderilmelidir.

Bedelsiz fatura düzenlendiğinde KDV 0 geçmesi durumunda satış faturası tipi seçilip 351 “istisna olmayan diğer” kodundan giriş yapılmalıdır. Faturanın not alanında ise 0 KDV geçildiği bilgisine yer verilmelidir.

E-fatura kesilmesi halinde e-fatura, e-arşiv faturası kesilmesi halinde e-arşiv fatura logosunun bulunması gerekir.
 
E-arşiv fatura logosu kullanılarak başarılı bir şekilde gönderilen e-faturalar için alıcı taraf faturalara harici yollarla itiraz edilmelidir. İtirazın öncesinde fatura zarfının durumunun olduğunu gördüğünden gönderici bu faturayı kayıtlarında göstermelidir. İtiraz edilmesinin ardından gönderici faturayı kayıtlarından ters kayıtla çıkarılmalıdır. Eğer alıcı ise faturayı hiç kayıtlarına almadan Türk Ticaret Kanunu’nda yer alan itiraz yöntemlerinden birisi kullanılarak faturaya itirazda bulunulması gerekmektedir.
 
Daha sonra gönderici doğru logoyu kullanarak yeni bir fatura oluşturmalıdır. Doğru alıcısına e-fatura sistemi üzerinden gönderilmelidir.

E-arşiv fatura kullanıcıları vergi mükellefi olmayan ve fatura düzenleme sınırının altında kalan işlemler için perakende satış fişi düzenleyebilir.
ÖKC Mali Raporları 3 farklı yöntemle GİB’e bildirilebilir.
 
1-     ÖKC TSM Merkezilerinden
2-     GİB’den e-arşiv uygulaması kapsamında izin alan özel entegratör firmaların bilgi işlem sistemleri aracılığıyla
3-     GİB tarafından internet vergi dairesi üzerinden oluşturulan mükelleflerin kendileri tarafından kullanılabilecek elektronik portallar üzerinden bildirim olabilir.

Firma tarafından kullanılan Ödeme Kaydedici Cihazlarla düzenlenen ÖKC fişlerine ait olan bilgileri içeren günlük kapanış raporlarına ait mali bilgiler Gelir İdaresi Başkanlığı’na bildirilmelidir.
Kullanılan ÖKC’lerden kesilen fişlere ait olan mali bilgiler yeni nesil ÖKC sayfasında bulunan ÖKC Mali Rapor Kılavuzu’nda yer alan şartlara uygun bir şekilde 01.07.2018 tarihiyle GİB’e bildirilmesi gerekmektedir. Bu bildirimler 3 farklı yöntemle yapılır.
 
1 – ÖKC TSM Merkezlerinden
2 – GİB’de e-arşiv uygulaması kapsamında izin alan özel entegratör firmaların bilgi işlem sistemleri aracılığıyla
3 – GİB tarafından internet vergi dairesi üzerinden oluşturulan ve mükelleflerin kendileri tarafından kullanılan elektronik postalardan bildirim yapılabilir.

İade faturasına yeniden iade işlemi yapılamayacağından dolayı kabul ve red işlemleri de yapılamaz.

Elektronik fatura yeni bir belge türü değildir. Kağıt fatura ile aynı hukuki özelliklere sahiptir. Bu nedenle temel faturaya harici yollardan itiraz edilebilir. Mevzuatla ilgili ayrıntılı bilgiler ise mevzuat birimlerinden alınabilir.

Portal üzerinde KDV tevkifatı uygulanacak faturanın düzenlenmesi gerekiyorsa ilgili alandan KDV Tevkifatı seçilip Vergi Ekle kısmından ekleme yapılmalıdır. Böylece KDV tevkifat oranı ve KDV tevkifat tutarı şeklinde iki alan açılmaktadır ve iki alana da gerekli bilgiler girilerek fatura oluşturulabilir.

454 sıra numarasına sahip olan VUK Genel Tebliğ’ine göre; bu tebliğ kapsamında genel fatura ve elektronik defter uygulamasında geçme zorunluluğu getirilen mükellefler; tam olarak bölünme, birleşme veya tür değişikliğine gitmeleri halinde devrolunan veya birleştirilen tüzel kişi mükellefler ile tam bölünme veya tür değişikliği sonucunda ortaya çıkan yeni tüzel kişi mükellefler de e-fatura uygulamasına geçmek elektronik defter tutmak zorundadır. Bu durumda uygulamalara geçme süresinde hiçbir koşulda işlemin ticaret siciline tescil tarihini izleyen ayın başından itibaren 3 ayı geçmemesi gerekir.
 
Bu doğrultuda ise firmaların birleşme tarihleri de göz önünde bulundurularak söz konusu e-fatura ve e-defter uygulamasına başvuru yapılması gerekir.

Bu tarihten itibaren GİB bilgi sistemlerine; yalnızca eski nesil ÖKC’lerden bir aylık dönem içerisinde gerçekleştirilen satışlara ait mali bilgilerin bildirilmesi gerekir.
 
Yeni Nesil ÖKC’ler tarafından gerçekleştirilen satışlara ait olan mali bilgiler, ilgili ÖKC üreticilerine ait ÖKC TSM merkezleriyle GİB elektronik ortamda bildirilebildiğinden, genel prensip olarak mükelleflerden başka bir kanaldan bildirim yükümlülüğü bulunmadığından Tercih Bildiriminde bulunmak zorunda değildirler. Yeni nesil olan ÖKC’lere ait mali bilgiler ÖKC TSM merkezleri üzerinden GİB’e bildirilmesinde işletmeler açısından teknik ve altyapı sorunları ve ilave maliyet harcaması yapılması durumunda kalacak olan işletmeler; ÖKC TSM merkezleri yerine diğer iki yöntemden biriyle GİB’e bildirmeyi seçebilirler. Bu durumda ise tercih bildirimi ekranı üzerinden, ÖKC TSM merkezi dışında yer alan diğer iki yöntemden biri seçilerek yöntem tercihinde bulunulacaktır.